Error:Unable to load class 'org.gradle.nativeplatform.internal.DefaultBuildType_Decorated'.

よくわからない状態になったらこんなエラーメッセージが表示されるようになってビルドも何も通らなくなってしまった。

Error:Unable to load class 'org.gradle.nativeplatform.internal.DefaultBuildType_Decorated'. Possible causes for this unexpected error include:

• You are using JDK version 'java version "1.7.0_79"'. Some versions of JDK 1.7 (e.g. 1.7.0_10) may cause class loading errors in Gradle. Please update to a newer version (e.g. 1.7.0_67). Open JDK Settings
• Gradle's dependency cache may be corrupt (this sometimes occurs after a network connection timeout.) Re-download dependencies and sync project (requires network)
• The state of a Gradle build process (daemon) may be corrupt. Stopping all Gradle daemons may solve this problem. Stop Gradle build processes (requires restart)
• Your project may be using a third-party plugin which is not compatible with the other plugins in the project or the version of Gradle requested by the project.

In the case of corrupt Gradle processes, you can also try closing the IDE and then killing all Java processes.

挙句の果てにJDK 8u60もインストールして 1.8にバージョンアップさせたりしてもやはりだめ（笑）

結局検索してみると、いつものスタックオーバーフローが引っかかり
Android Studio: Gradle Build fails with error: Unable to load class 'com.android.build.gradle.ndk.NdkPlugin' にて

Vinod Khosla「Try cleaning your project and re-build.」

とのこと。プロジェクトのクリーンとリビルドを試しなさい。ってことでエラーがまともに出るようになりました。
以前おかしな挙動が収まらなかったときは、プロジェクト内の自動生成物をほとんど削除すればまともになったのですが、正当法はこちらなんでしょうね。